MASTER APPLIED BIOINFORMATICS FOR LIFE SCIENCES
RESPONSABIL MASTER: Conf. dr. Maria MERNEA
maria.mernea@bio.unibuc.ro
MISIUNE:
Misiunea programului de master „Applied Bioinformatics for Life Sciences” este de a răspunde cerințelor emergente din științele vieții, generate de creșterea exponențială a volumului de date biologice și de necesitatea integrării acestora în procesele de înțelegere a mecanismelor moleculare, de diagnostic și de dezvoltare a terapiilor moderne. Programul promovează abordarea interdisciplinară, gândirea critică, utilizarea responsabilă a tehnologiilor digitale și dezvoltarea cunoașterii la interfața dintre biologie și informatică.
Prin susținerea excelenței academice și a colaborării cu centre de cercetare avansate, programul creează un cadru favorabil inovării, transferului de cunoștințe și conectării cu tendințele internaționale în bioinformatică, contribuind activ la progresul domeniului și la consolidarea legăturii dintre educație, cercetare și societate.
SCOP:
Scopul programului de master „Applied Bioinformatics for Life Sciences” este de a forma specialiști capabili să aplice metode computaționale avansate în analiza datelor biologice și biomedicale, integrarea acestora în modele predictive și dezvoltarea de soluții inovatoare în domenii precum medicina personalizată, biotehnologiile moderne și farmacologia moleculară. Programul urmărește să ofere o pregătire solidă în bioinformatică aplicată, cu accent pe abordările „-omice”, dinamica moleculară, farmacogenomică și analiza interacțiunilor biologice, în vederea integrării eficiente a absolvenților în mediul academic, industrial sau clinic, la nivel național și internațional.
OBIECTIVE:
- Obţinerea de competenţe în domenii producătoare de date biologice: genomică, transcriptomică, proteomică, farmacogenomică;
- Dobândirea de competenţe în gestionarea şi analiza datelor biologice prin aplicarea de metode specifice bioinformaticii;
- Achiziţia de cunoştinţe şi deprinderea de tehnici necesare studiului dinamicii moleculare in silico;
- Dezvoltarea competenţelor profesionale, a capacităţii de a gândi interdisciplinar şi de a face conexiuni între informaţii cu aplicabilitate în bioinformatică;
- Dezvoltarea abilităţilor de rezolvare a problemelor în bioinformatică;
- Dezvoltarea capacităţii de a realiza cercetare ştiinţifică de calitate.

ABLS
Admitere ABLS
Cadre didactice:
- Prof. dr. Avram Speranţa
- Prof. dr. Mihailescu Dan Florin
- Conf. dr. Amuzescu Bogdan
- Conf. dr. Dinescu Sorina
- Conf. dr. Galateanu Bianca
- Conf. dr. Ionica Elena Emilia
- Conf. dr. Mernea Maria
- Conf. Stan Miruna Silvia
- Lect. dr. Diaconu Mihaela Stefania
Tutori:
- …
Competenţe profesionale:
- Inţelegerea tehnologiilor bazate pe ştiinţe „omice” (genomică, transcriptomică, proteomică) şi a modului cum pot fi aplicate în cercetările din domeniul ştiinţelor vieţii şi în medicina personalizată
- Capacitatea de a aplica metode de genomică, transcriptomică şi proteomică, de a identifica limitările metodelor, de a implementa inovativ şi creativ progresele tehnologice în domeniile menţionate
- Capacitatea de a aplica metode de bioinformatică pentru a analiza datele rezultate prin utilizarea tehnologiilor „omice”
- Capacitatea de a utiliza informaţiile şi metodele de analiză existente în baze de date pentru secvenţe de proteine, genomuri, gene, nucleotide, structuri de proteine, variante cu semnificaţie clinică, compuşi chimici cu activitate farmacologică, etc.
- Cunoaşterea principalelor formate de fişiere utilizate în bioinformatică, a algoritmilor de căutare şi a metodelor de analiză a secvenţelor
- Capacitatea de a utiliza metode bioinformatice şi de modelare moleculară pentru a prezice dinamica biomoleculelor şi mecanismele de acţiune a agenţilor farmacologici
- Inţelegerea modului în care tehnicile de bioinformatică pot fi aplicate în medicina personalizată
- Capacitatea de a stabili un plan de lucru (cercetare) prin identificarea metodologiei adecvate, predicţia dificultăţilor ce se pot ivi şi stabilirea soluţiilor alternative
- Capacitatea de a finaliza un proiect de cercetare şi a interpreta corect datele obţinute.
Analiza corelaţiei programului de studii cu cerinţele pieţei muncii:
Bioinformatica este un domeniu a cărui importanţă este semnificativă în contextul în care zilnic se produc cantităţi crescătoare de date biologice. Pentru lucrul cu astfel de informaţii sunt necesari specialişti în bioinformatică dedicaţi stocării, identificării, procesării, analizei sau vizualizării acestor date. Un avantaj suplimentar ar fi ca aceşti specialişti să posede un bagaj de cunoştinţe solide în domeniile biologiei producătoare de date biologice, respectiv ştiinţele „omice”, care să ghideze interpretările datelor şi rafinarea metodelor de analiză. In acest context, prezentul program de studii îşi propune formarea de specialişti capabili nu doar să analizeze şi să efectueze predicţii bazate pe datele experimentale utilizând metode computaţionale, ci şi să obţină date experimentale, având o bună înţelegere a metodelor de biologie moleculară utilizate. Aceste competenţe sunt extrem de necesare atât în mediul academic, cât şi în mediul economic, servind fie pentru activităţi de cercetare, fie pentru interpretarea datelor obţinute în laboratoarele de analize biomedicale.
Utilitatea bioinformaticii nu se limitează doar la a oferi metode de analiză a datelor, ci se extinde la a realiza predicţii pe baza datelor experimentale şi la a ghida experimentele pentru a răspunde la întrebările care rezultă din analiza bioinformatică a datelor. Date fiind acestea, în actuala piaţă de muncă există o mare cerere pentru bioinformaticieni. Acest fapt este extrem de evident în străinătate, unde marile companii farmaceutice, biotehnologice sau dezvoltatoare de software sunt extrem de interesate pentru a găsi indivizi capabili să lucreze cu cantităţi imense de date biologice sau provenite din clinică (Alaina G. Levine, An Explosion Of Bioinformatics Careers, Science, 13.06.2015). De asemenea, în străinătate există un număr mare de poziţii pentru bioinformaticieni în mediul academic, fiind căutaţi doctoranzi, postdoctoranzi sau cercetători cu calificare în bioinformatică. Intrucât limba de predare a masterului este engleza, absolvenţii acestui master vor putea viza ocuparea unui loc de muncă de bioinformatician în străinătate.
In România, bioinformaticienii încep să fie căutaţi pentru analiza de date (genetice, de spectrometrie de masă, etc), dezvoltarea de programe care însoţesc echipamentele de laborator (echipamente pentru PCR, pentru microarray, etc) sau pentru vânzarea a astfel de echipamente. Atât laboratoare de cercetare, cât şi laboratoarele private de analize se confruntă cu probleme legate de: (i) lipsa programelor de analiză de date care să poată fi utilizate într-o modalitate similară indiferent de echipamentul utilizat pentru înregistrarea datelor; (ii) lipsa de reproductibilitate a rezulatelor analizei datelor, aspect datorat subiectivismului utilizatorului în alegerea parametrilor utilizaţi pentru analiza datelor; (iii) lipsa de instruire în domeniul bioinformaticii a personalului, ceea ce împiedica exploatarea la potenţial maxim a datelor înregistrate; (iv) alegerea dificilă a unui program de analiză de date perfect adaptat nevoilor laboratorului; (v) dificultăţi în a opera cu bazele de date existente şi în a posta informaţiile obţinute într-o baza de date. Prin intermediul acestui program masteral vom pregăti specialişti capabili să rezolve problemele enumerate mai sus.
Intr-un laborator de analize, fie în scop de cercetare, fie comerciale, absolvenţii acestui program masteral se vor integra realizând activităţi care suportă analizele realizate prin utilizarea metodelor specifice bioinformaticii pentru analiza datelor, vor putea aplica metodele de biologie moleculară însuşite pentru a obţine date pe care ulterior le vor analiza sau vor fi implicaţi în dezvoltarea de metode şi algoritmi necesari pentru a răspunde unei nevoi specifice a laboratorului. Pe de altă parte, absolvenţii masterului vor putea continua pregătirea profesională prin realizarea studiilor doctorale, după care se vor putea implica în activităţi educaţionale, fie urmând o carieră academică, fie participând la instruirea şi perfecţionarea personalului laboratoarelor. Având o pregătire prealabilă în domeniul medical, absolvenţii acestui master vor putea realiza activităţi de bioinformatică medicală. Competenţele acestora sunt utile pentru stabilirea de tratamente personalizate (farmacogenomica), respectiv pentru identificarea medicamentului care va funcţiona optim raportat la profilul genetic al pacientului.
Datorită nevoii curente de specialişti în domeniul bioinformaticii, considerăm ca masterul Applied Bioinformatics for Life Science (Bioinformatică aplicată în ştiinţele vieţii) este în acord cu cerinţele pieţei muncii. Disciplinele care vor fi predate studenţilor vor asigura pregătirea de specialişti apţi să răspundă problemelor cu care se confruntă în prezent laboratoarele de analize şi care, prin activitatea lor, vor aduce beneficii suplimentare laboratorului în care sunt angajaţi.
Oportunități de perfecționare:
Incă de pe durata studiilor studenţii vor avea posibilitatea de a efectua practică în laboratoarele care ţin de centrele de cercetare afiliate celor două departamente implicate în organizarea acestui program de studii:
- Baza de Cercetare cu Utilizatori Multipli – Neurobiologie şi Fiziologie Moleculară (BCUM-NFM), afiliat DAFAB;
- Baza de Cercetare cu Utilizatori Multipli – Biologie Moleculară (BCUM-BM), afiliat DBBM
- Centrul de Cercetare de Biochimie şi Biologie Moleculară (CCBBM), afiliat DBBM.
Adiţional, studenţii vor avea acces la laboratoarele (https://erris.gov.ro/Department-of-Bioinformatics ; http://erris.gov.ro/DMI-PCBE ) din cadrul Platformei de Cercetare in Biologie si Ecologie Sistemica (PCBE) şi pot beneficia de burse şi granturi oferite de Institutului de Cercetare al Universităţii din Bucureşti (ICUB – http://icub.unibuc.ro).
Oportunități de angajare și de dezvoltare a carierei:
Ocupaţii COR vizate:
- Consilier biolog, Expert biolog, Referent de specialitate biolog, Biolog, Consilier biochimist, Expert biochimist, Referent de specialitate biochimist, Consilier farmacolog, Expert farmacolog, Referent farmacolog, Farmacolog, Cercetător în biologie chimie, Asistent de cercetare în biologie chimie (COR 2131)
- Cercetător în biochimie tehnologică, Asistent de cercetare în biochimie tehnologică (COR 2113)
- Profesori universitari şi asociaţi (COR 2310)
- Începând cu 11 februarie 2025, Bioinformatica este recunoscută oficial ca profesie de către Statul Român. În Clasificarea Ocupațiilor din România (COR) va fi introdus codul 213153 – Cercetător în bioinformatică, încadrat în grupa de bază 2131 – Biologi, botaniști, zoologi și alte funcții asimilate. După publicarea în Monitorul Oficial, ocupaţiile vizate de către acest master vor fi actualizate pentru a introduce noua ocupaţie de Cercetător în bioinformatica.
Pentru a aprofunda direcţia de studiu, absolvenţii masterului pot opta pentru participarea la un program de pregătire doctorală. O parte dintre cadrele didactice asociate acestui master sunt afiliate Şcolii Doctorale de Biologie, Universitatea din Bucureşti. Acestea vor prezenta studenţilor cele mai noi direcţii de cercetare şi le vor da posibilitatea să pornească studii care vor avea continuitate în cadrul pregătirii doctorale. De asemenea, aceste cadre didactice sunt directori sau responsabili pentru granturi de cercetare, cei mai buni studenţi având posibilitatea de a fi angajaţi pe un astfel de proiect.
This post is also available in: English (Engleză)